A história de Alagoinhas teve início no final do século XVIII, quando um padre português ergueu uma capela na região. Com o tempo, o povoado cresceu ao redor da Igreja de Santo Antônio e, em 1853, foi oficialmente instalado como município. 

A posição estratégica nas rotas de boiadas e a chegada de imigrantes renderam à cidade o título de “Pórtico de Ouro do Sertão Baiano”, dado por Ruy Barbosa. E, antes de ser Alagoinhas, a localidade teve outros nomes, como Freguesia da Água Fria, Freguesia de Santo Antônio das Lagoinhas e Villa de Santo Antônio d’Alagoinhas. 

O crescimento de Alagoinhas ganhou força com a chegada da Estrada de Ferro da Bahia ao São Francisco, em 1868. A estação ferroviária reorganizou a cidade e atraiu comércio e novos moradores. 

Em 1964, a descoberta do poço de petróleo MG-1-BA transformou a economia da cidade. Isso trouxe mais investimentos, gerou empregos e consolidou Alagoinhas como polo regional de mais de 30 municípios vizinhos.