Fraiburgo nasceu do trabalho dos irmãos Rene e Arnoldo Frey, que impulsionaram o desenvolvimento do município. Um marco histórico foi a chegada das primeiras mudas comerciais de maçã no Brasil, atraindo visitantes e consolidando Fraiburgo como a "Terra da Maçã".

O turismo regional cresce durante o período da colheita de maçã, entre janeiro e abril. A gastronomia típica também se destaca, com pratos à base de maçã e o tradicional Michuim, uma ovelha no rolete, influência dos franceses.

As primeiras fazendas surgiram após a Revolução Farroupilha e a Guerra do Paraguai e duas delas foram importantes para o surgimento de Fraiburgo, as fazendas Liberata e Butiá Verde.

Fraiburgo foi elevada à categoria de município pela em 20 de dezembro de 1961, se desmembrando de Curitibanos e Videira. A instalação ocorreu em 31 de dezembro de 1961, data que marca o aniversário da cidade.