O nome Pirassununga vem do tupi e significa "lugar onde o peixe faz barulho". A origem está na Cachoeira de Emas, onde ocorre o fenômeno da piracema, que é quando os que peixes nadam contra a correnteza do Rio Mogi Guaçu, emitindo sons parecidos com roncos.

Esse fenômeno natural marcou tanto os povos originários que eles nomearam a região com essa expressão, unindo "Pirá" (peixe), "Sunu" (barulho) e "Nga" (lugar).

Pirassununga começou a se formar em 1823 com a construção de uma capela de taipa onde foi celebrada a primeira missa em terras do Bairro do Senhor Bom Jesus dos Aflitos. Esse é considerado o marco da fundação da cidade.

A chegada da ferrovia em 1878 impulsionou o crescimento e, já no século XX, o Dr. Fernando de Sousa Costa trouxe para a região instituições como a Academia da Força Aérea, que alavancaram o desenvolvimento econômico e populacional.