A cidade de Timon nasceu a partir de São José das Cajazeiras. O povoado foi elevado à categoria de vila em 1890, recebendo o nome Vila de Flores. Três anos depois, foi rebaixada, pois não tinha a infraestrutura necessária para ser considerada vila.

Flores, porém, voltou a ser vila em 1896, após atender às exigências legais, e, em 1922, foi elevada à categoria de cidade. Nessa época, o Coronel Firmo Pedreira doou terras para o patrimônio municipal, onde foi construída a primeira capela da região.

Já em 1943, o município de Flores passou a se chamar Timon. Isso ocorreu porque havia uma proibição do Governo Federal sobre o uso do mesmo nome para mais de uma cidade brasileira. "Timon" foi escolhido com inspiração no nome do primeiro jornal que circulou em São Luís.

Situada na margem esquerda do Rio Parnaíba, fazendo divisa com Teresina (PI), Timon integra a Região Metropolitana de Teresina.